¿Alguna vez está bien permitir que un huésped que pase la noche prolongue su estadía sin hablarlo primero con su compañero de residencia?

Siempre deberías hablarlo. Debería haber discutido la estadía de un amigo, seguro. Si el huésped fuera un hermano o padre, y no planeara más de uno o dos días adicionales, creo que cualquiera de ustedes tendría derecho a que la persona se quede, a menos que su pareja se oponga enérgicamente.