En lugar de responder la pregunta directamente, sugiero comenzar con algunas preguntas más para centrar su mente en cuáles son sus necesidades y capacidades. Una de mis suposiciones es que estas muestras familiares se recopilarán con fines de secuenciación de ADN para descubrir o confirmar información genética hereditaria que se puede obtener del ADN genómico y mitocondrial. Otra suposición es que usted sabe lo suficiente sobre el tema, ya que está pensando en recolectar la muestra ahora y esperar que caiga el precio del análisis y que los proveedores de servicios que trabajan con el público en general sean más accesibles; ambos de los cuales seguirán sucediendo.
También asumo que una vez que se pueda cumplir con su punto de precio y proveedor de servicios de secuenciación, que incluso estarían de acuerdo con muestras de secuencia que podrían no tener el consentimiento adecuado de las personas de las que provienen; Este es un problema en el que no tengo experiencia, pero puede ser una preocupación si realmente quiere hacer algo con estas muestras. A menos que tenga las credenciales adecuadas, los acuerdos de uso de investigación o los documentos de consentimiento del paciente, dudo que muchos proveedores de servicios de secuenciación simplemente secuenciarán sus muestras y le entregarán los datos solo porque puede pagarlos por los servicios. Todo mi trabajo esta hecho bajo con
Consideraciones para la recolección y almacenamiento de ADN genómico;
· ¿A qué tipo de muestras de miembros de la familia tiene acceso?
¿Sangre entera, desgarro de mejillas, otras muestras de tejido?
· ¿Por qué recoger las muestras ahora? ¿Estaría simplemente recolectando a los miembros mayores de su familia, o hay alguna otra razón convincente para recolectar todas las muestras ahora?
· ¿Cómo recogerás la muestra?
o Por ejemplo, ¿todos los miembros de la familia están dispuestos a someterse a una extracción de sangre y tiene usted acceso a un método seguro para recolectar esta sangre? ¿Está confiando en los servicios profesionales o en su propia capacidad para recolectar la muestra?
o ¿Se recogerán las muestras de una vez, como en una reunión familiar, o cada miembro las recogerá y almacenará durante un amplio intervalo de tiempo?
o Una vez recogidos, ¿cómo serán almacenados y enviados? ¿Cuál es el tiempo de esta recolección, almacenamiento y envío antes de que pueda hacer algo más permanente con las muestras?
o ¿Tendrá diferentes tipos de muestras, ya que al igual que muchas familias, la suya no puede ponerse de acuerdo sobre lo que hay para cenar y mucho menos una muestra para el almacenamiento de ADN genómico?
· ¿Qué tipo de respuestas de la secuencia estás buscando? ¿Relaciones familiares, enfermedades específicas o análisis de todo el genoma para descubrir variantes genómicas?
· ¿Qué considera una secuenciación genómica asequible por persona? ¿Qué puedes pagar? Esto puede ser una consideración para el tipo de prueba que habría realizado, el tipo de muestra que necesitaría planificar y el tiempo de almacenamiento que tendría que esperar para que ese precio sea “razonable” para usted.
· ¿Conoces las historias médicas de los miembros de tu familia para acompañar estas muestras? ¿Ya que eso es algo que podría recopilar ahora que es casi tan útil, pero también se combinará bien con la información genética que se tomaría con todo este problema?
· Una vez tengas las muestras biológicas;
o ¿Tiene acceso a un laboratorio de biología básica con al menos pipetas y una microcentrífuga? ¿Para que puedas realizar un simple kit de extracción de ADN genómico basado?
o ¿Cuánto puede pagarle a alguien que tiene esta capacidad para ayudar a procesar sus muestras antes del almacenamiento?
o ¿Prefiere no procesar la muestra a ADN genómico purificado, sino dejarla como la muestra biológica completa? Nota: el ADN genómico tendrá un costo relativamente bajo para almacenar una vez purificado, ya que puede almacenarse de manera segura durante al menos una década entre temperatura ambiente o -80 ° C, según el método, mientras que una muestra biológica completa tendrá una mayor tasa de degradación o requiere un almacenamiento mucho más frío y costoso, piense en al menos -20’C congelador por un corto tiempo a nitrógeno líquido por un período mucho más largo.
Una vez que pueda responder algunas de estas preguntas, será mucho más fácil encontrar la solución adecuada para su problema. También puedes ver la página wiki para tener un conocimiento básico de la extracción de ADN genómico de las células, también tienen un enlace a los métodos;
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Extracción de ADN
No estoy respaldando ninguno de los siguientes métodos o productos, ni estoy sugiriendo ninguno que tenga un conflicto de intereses. Los siguientes son simplemente kits o métodos que he usado personalmente o que son comparables a los que he usado.
Hay kits simples para procesar muestras de sangre total o de tejido de la mejilla con un laboratorio de biología relativamente poco equipado: (haga una búsqueda de “extracción de ADN genómico” para encontrar más, o comience con los enlaces que ofrezco y busque palabras clave que también sean relevantes para su tipo de muestra)
· Qiagen; Kit de ADN de sangre PAXgene
· Zymo Research; ADN genómico – ADN
· Tecnologías de la vida; Extracción de ADN genómico
· BioChain; Extracción y aislamiento de ADN, extracción automatizada de ADN en sangre, aislamiento de ADN en plantas
· Roche; Kit de aislamiento de ADN para sangre de mamífero
También hay reactivos, que se enumeran son solo algunos, que pueden almacenar raspaduras celulares o sangre sin procesarlos más. (haga una búsqueda de “estabilización de ARN en la muestra de sangre de células” para encontrar más)
· Qiagen; Reactivo de tejido Allprotect
· Life Tech; Solución de estabilización RNAlater – Life Technologies
También hay proveedores de servicios que pueden procesar muestras a ADN genómico purificado de forma relativamente económica, dependiendo de su definición de “barato”. (una búsqueda rápida del servicio de extracción de ADN genómico arrojaría varios clientes potenciales al igual que contactar a su universidad local o agregar ese nombre a la búsqueda por palabra clave)
Aunque de una compañía de secuenciación que puede tener algunos conflictos para recomendar kits particulares, aquí hay buena información (Extracción y almacenamiento de ADN) si va a elegir los kits y hacer el trabajo usted mismo, especialmente en relación con;
· Usar etanol absoluto si se requiere para hacer reactivos en kits en lugar de otros grados de etanol
· Elegir métodos que usen un fenol / cloroformo, a los que no me referí en absoluto aquí por este motivo, para purificar el ADN genómico
· Y almacenamiento de ADN purificado en 1x TE pH 8.0 o similar en lugar de agua
Estaré encantado de ayudarle a responder sus preguntas a medida que refine sus necesidades y capacidades.