1. Los defectos a veces son el resultado de mutaciones y contratiempos de desarrollo prenatal (debido a la exposición a sustancias químicas nocivas, infecciones, desnutrición, etc.). Estos son contratiempos casuales que la selección natural nunca puede eliminar totalmente. De hecho, en el caso de las mutaciones, la evolución a través de la selección natural ni siquiera sería posible sin ellas.
2. Un alelo que es beneficioso cuando solo está presente una copia a veces causa defectos si hay dos copias presentes. El efecto beneficioso del genotipo de alelo único permite que el alelo se mantenga a una cierta frecuencia dentro de la población si el tamaño de este beneficio supera el efecto negativo del genotipo de dos alelos. En otras palabras, el genotipo heterocigoto es ventajoso, pero el genotipo homocigoto es perjudicial. Este es el caso de Tay-Sachs, si no recuerdo mal.
3. Este es similar al ejemplo número dos. Los genes no funcionan de forma aislada. Sus efectos (y si esos efectos son ventajosos o perjudiciales) dependen de los antecedentes genéticos (es decir, del resto del genoma) y del entorno en el que operan. Con ciertos alelos presentes en otras partes del genoma, un alelo particular podría ser beneficioso, y con ciertos otros alelos presentes en otras partes del genoma, ese mismo alelo podría ser perjudicial. De manera similar, un alelo en particular puede ser beneficioso en un ambiente determinado (por ejemplo, un ambiente en el que hay una mayor exposición a ciertos patógenos y una menor exposición al azúcar refinado y las grasas trans), mientras que ese mismo alelo puede ser perjudicial en un ambiente diferente.
4. Si un alelo era claramente beneficioso anteriormente en la evolución humana pero ahora es claramente perjudicial, podría darse el caso de que la selección natural todavía esté en el proceso de desacelerar la eliminación de ese alelo, pero simplemente no haya terminado aún el trabajo.
5. En algunos casos, podría ser cierto que hay ciertas características estructurales y funcionales del ADN (es decir, la forma en que se empaqueta, se replica, “corrige”, etc.) que son ventajosas en general, pero que también hacen que ciertos tipos de errores lo suficientemente probables como para que aparezcan en la población con una frecuencia notable. No estoy seguro, pero este podría ser el caso de las trisomías.